控花基因怎样设计引物?

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/04/29 10:16:36
控花基因怎样设计引物?

控花基因怎样设计引物?
控花基因怎样设计引物?

控花基因怎样设计引物?
1.典型的引物18到24个核苷长.引物需要足够长,保证序列独特性,并降低序列存在于非目的序列位点的可能性.但是长度大于24核苷的引物并不意味着更高的特异性.较长的序列可能会与错误配对序列杂交,降低了特异性,而且比短序列杂交慢,从而降低了产量.
2.选择GC含量为40％到60％或GC含量映像模板GC含量的引物.
3.设计5'端和中间区为G或C的引物.这会增加引物的稳定性和引物同目的序列杂交的稳定性.
4.避免引物对3'末端存在互补序列,这会形成引物二聚体,抑制扩增.
5.避免3'末端富含GC.设计引物时保证在最后5个核苷中含有3个A或T.
6.避免3'末端的错误配对.3'端核苷需要同模板退火以供聚合酶催化延伸.
7.避免存在可能会产生内部二级结构的序列,这会破坏引物退火稳定性.

如果是PCR引物的话
如果你已经找到了这个基因，并且知道了序列的话
可以直接使用引物设计软件 或者
如果NCBI里面有的话
可以直接在网页里面完成

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